Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYH9

UTP6, U3 small nucleolar RNA-associated protein 6 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP6Q9NYH9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UTP6Q9NYH9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
UTP6Q9NYH9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UTP6Q9NYH9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UTP6Q9NYH9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UTP6Q9NYH9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UTP6Q9NYH9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UTP6Q9NYH9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UTP6Q9NYH9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UTP6Q9NYH9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UTP6Q9NYH9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UTP6Q9NYH9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UTP6Q9NYH9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UTP6Q9NYH9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UTP6Q9NYH9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UTP6Q9NYH9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UTP6Q9NYH9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UTP6Q9NYH9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UTP6Q9NYH9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
UTP6Q9NYH9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UTP6Q9NYH9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
UTP6Q9NYH9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UTP6Q9NYH9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
UTP6Q9NYH9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UTP6Q9NYH9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms