Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BSDC1Q9NW68 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BSDC1Q9NW68 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms