Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATAD3AQ9NVI7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATAD3AQ9NVI7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATAD3AQ9NVI7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATAD3AQ9NVI7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATAD3AQ9NVI7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATAD3AQ9NVI7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATAD3AQ9NVI7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATAD3AQ9NVI7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms