Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PARVAQ9NVD7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PARVAQ9NVD7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PARVAQ9NVD7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PARVAQ9NVD7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PARVAQ9NVD7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PARVAQ9NVD7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PARVAQ9NVD7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PARVAQ9NVD7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PARVAQ9NVD7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PARVAQ9NVD7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PARVAQ9NVD7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PARVAQ9NVD7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms