Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMC4Q9NTJ3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMC4Q9NTJ3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMC4Q9NTJ3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMC4Q9NTJ3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMC4Q9NTJ3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SMC4Q9NTJ3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMC4Q9NTJ3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMC4Q9NTJ3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SMC4Q9NTJ3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMC4Q9NTJ3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMC4Q9NTJ3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMC4Q9NTJ3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMC4Q9NTJ3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMC4Q9NTJ3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMC4Q9NTJ3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMC4Q9NTJ3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMC4Q9NTJ3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMC4Q9NTJ3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMC4Q9NTJ3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMC4Q9NTJ3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMC4Q9NTJ3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMC4Q9NTJ3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMC4Q9NTJ3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMC4Q9NTJ3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SMC4Q9NTJ3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SMC4Q9NTJ3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMC4Q9NTJ3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMC4Q9NTJ3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMC4Q9NTJ3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMC4Q9NTJ3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMC4Q9NTJ3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMC4Q9NTJ3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMC4Q9NTJ3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMC4Q9NTJ3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMC4Q9NTJ3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMC4Q9NTJ3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMC4Q9NTJ3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMC4Q9NTJ3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMC4Q9NTJ3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMC4Q9NTJ3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMC4Q9NTJ3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMC4Q9NTJ3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMC4Q9NTJ3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMC4Q9NTJ3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms