Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMSN1Q9NSI8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMSN1Q9NSI8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms