Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF275Q9NSD4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms