Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOMER2Q9NSB8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOMER2Q9NSB8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOMER2Q9NSB8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOMER2Q9NSB8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms