Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TULP4Q9NRJ4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms