Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLE3Q9NRF9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms