Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C8orf4Q9NR00 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms