Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 JPT1-201ENST00000304834 1633 ntTSL 1 (best)18.05■□□□□ 0.482e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.482e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 BCAS3-229ENST00000592702 2094 ntTSL 1 (best)18.02■□□□□ 0.472e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 GTSE1-203ENST00000479645 1111 ntTSL 1 (best)18■□□□□ 0.472e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.472e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.452e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.452e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ZNF180-208ENST00000591064 837 ntTSL 317.82■□□□□ 0.444e-8■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.442e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 FAM171A1-202ENST00000455654 605 ntTSL 317.78■□□□□ 0.442e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.448e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.432e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.432e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.422e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.422e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 PSMD9-205ENST00000538613 534 ntTSL 217.65■□□□□ 0.422e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 BCAS3-205ENST00000585812 2214 ntTSL 217.64■□□□□ 0.412e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.412e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SAP30BP-219ENST00000583170 553 ntTSL 417.61■□□□□ 0.412e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SAP30BP-204ENST00000577292 1097 ntTSL 217.61■□□□□ 0.412e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SAP30BP-221ENST00000583536 1000 ntTSL 317.61■□□□□ 0.412e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 C20orf204-203ENST00000444463 4303 ntTSL 1 (best)17.61■□□□□ 0.412e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.42e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 C19orf66-204ENST00000586730 1655 nt17.52■□□□□ 0.399e-18■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.392e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.392e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.381e-6■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 RARG-205ENST00000543762 1620 ntTSL 217.39■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.372e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.372e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 EARS2-204ENST00000562581 533 ntTSL 517.35■□□□□ 0.372e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.352e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.359e-18■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.342e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 C9orf3-206ENST00000428313 2288 ntTSL 1 (best)17.16■□□□□ 0.341e-7■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 RTKN-208ENST00000479256 564 ntTSL 517.15■□□□□ 0.342e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.346e-12■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 POR-213ENST00000448410 1104 ntTSL 317.11■□□□□ 0.332e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ITIH5-205ENST00000468389 1393 ntTSL 217.09■□□□□ 0.332e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.316e-12■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 NCAPH2-210ENST00000523045 970 ntTSL 517■□□□□ 0.312e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.312e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TRPS1-206ENST00000517323 2171 ntTSL 516.95■□□□□ 0.34e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.32e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.292e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 RNF34-204ENST00000553407 1612 ntTSL 216.87■□□□□ 0.299e-18■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.298e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CACNB1-206ENST00000539338 5308 ntTSL 1 (best)16.86■□□□□ 0.292e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.282e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 POR-203ENST00000412521 586 ntTSL 416.82■□□□□ 0.282e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 C12orf43-207ENST00000538296 585 ntAPPRIS ALT2 TSL 316.8■□□□□ 0.282e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.282e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 FAM118B-205ENST00000528985 1311 ntTSL 516.76■□□□□ 0.272e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.278e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.272e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.272e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.272e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.278e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.276e-12■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.266e-12■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.262e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.262e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 WWOX-213ENST00000566662 571 ntTSL 416.63■□□□□ 0.252e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 GTSE1-202ENST00000466510 1330 ntTSL 1 (best)16.58■□□□□ 0.242e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 AC009961.1-201ENST00000453016 401 ntTSL 516.57■□□□□ 0.242e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.234e-8■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 MIGA2-212ENST00000494608 445 ntTSL 316.51■□□□□ 0.232e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.232e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.232e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.222e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 COLEC11-210ENST00000419002 520 ntTSL 316.41■□□□□ 0.222e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.214e-8■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SNX6-205ENST00000555648 467 ntTSL 316.37■□□□□ 0.212e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 POU2F2-203ENST00000524801 622 ntTSL 316.36■□□□□ 0.212e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SAP30BP-205ENST00000578288 870 ntTSL 1 (best)16.36■□□□□ 0.212e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.212e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.216e-12■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.22e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.22e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.198e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 WWOX-209ENST00000563358 724 ntTSL 316.22■□□□□ 0.192e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.182e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SLC38A5-211ENST00000615300 797 ntTSL 316.18■□□□□ 0.182e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CORO6-211ENST00000584602 559 ntTSL 316.13■□□□□ 0.172e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CYP26A1-205ENST00000624589 1456 ntTSL 516.13■□□□□ 0.172e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.166e-12■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SAP30BP-217ENST00000582022 2409 ntTSL 1 (best)16.08■□□□□ 0.162e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 HADH-220ENST00000640060 1895 ntTSL 516.08■□□□□ 0.162e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ALKBH3-203ENST00000527029 569 ntTSL 216.02■□□□□ 0.162e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 BIN2-207ENST00000605039 2781 ntTSL 1 (best)16■□□□□ 0.152e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 GABARAPL1-208ENST00000540424 2321 ntTSL 215.98■□□□□ 0.152e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 JPT1-210ENST00000580380 411 ntTSL 515.96■□□□□ 0.152e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.148e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.148e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.148e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.132e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 APC2-207ENST00000590877 781 ntTSL 215.89■□□□□ 0.132e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SAP30BP-222ENST00000583737 525 ntTSL 415.86■□□□□ 0.132e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.131e-6■■■■■ 223.6
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