Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MEPEQ9NQ76 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MEPEQ9NQ76 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms