Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC52A3Q9NQ40 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC52A3Q9NQ40 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC52A3Q9NQ40 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC52A3Q9NQ40 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC52A3Q9NQ40 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC52A3Q9NQ40 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC52A3Q9NQ40 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC52A3Q9NQ40 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC52A3Q9NQ40 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC52A3Q9NQ40 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC52A3Q9NQ40 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC52A3Q9NQ40 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC52A3Q9NQ40 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC52A3Q9NQ40 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC52A3Q9NQ40 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC52A3Q9NQ40 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC52A3Q9NQ40 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC52A3Q9NQ40 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC52A3Q9NQ40 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC52A3Q9NQ40 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC52A3Q9NQ40 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC52A3Q9NQ40 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC52A3Q9NQ40 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC52A3Q9NQ40 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC52A3Q9NQ40 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC52A3Q9NQ40 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC52A3Q9NQ40 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC52A3Q9NQ40 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC52A3Q9NQ40 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC52A3Q9NQ40 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC52A3Q9NQ40 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms