Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ3

DNAJC4, DnaJ homolog subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DNAJC4Q9NNZ3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJC4Q9NNZ3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJC4Q9NNZ3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJC4Q9NNZ3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJC4Q9NNZ3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJC4Q9NNZ3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJC4Q9NNZ3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJC4Q9NNZ3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJC4Q9NNZ3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJC4Q9NNZ3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJC4Q9NNZ3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJC4Q9NNZ3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJC4Q9NNZ3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJC4Q9NNZ3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJC4Q9NNZ3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJC4Q9NNZ3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJC4Q9NNZ3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJC4Q9NNZ3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJC4Q9NNZ3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJC4Q9NNZ3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJC4Q9NNZ3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJC4Q9NNZ3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJC4Q9NNZ3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJC4Q9NNZ3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJC4Q9NNZ3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJC4Q9NNZ3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJC4Q9NNZ3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAJC4Q9NNZ3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms