Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms