Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 AC025287.4-201ENST00000640173 1240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 CRYGB-201ENST00000260988 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 ZNF826P-202ENST00000542380 1067 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 AC097376.1-201ENST00000602907 997 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 AC109466.1-206ENST00000522686 774 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 MGST1-204ENST00000396209 979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SENP3Q9H4L4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms