Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T3

SEMA6B, Semaphorin-6B, humanhuman

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6BQ9H3T3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA6BQ9H3T3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA6BQ9H3T3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms