Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms