Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHACTR1Q9C0D0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHACTR1Q9C0D0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHACTR1Q9C0D0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHACTR1Q9C0D0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHACTR1Q9C0D0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHACTR1Q9C0D0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHACTR1Q9C0D0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PHACTR1Q9C0D0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHACTR1Q9C0D0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHACTR1Q9C0D0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHACTR1Q9C0D0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHACTR1Q9C0D0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHACTR1Q9C0D0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHACTR1Q9C0D0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHACTR1Q9C0D0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHACTR1Q9C0D0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHACTR1Q9C0D0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHACTR1Q9C0D0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHACTR1Q9C0D0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHACTR1Q9C0D0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHACTR1Q9C0D0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHACTR1Q9C0D0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHACTR1Q9C0D0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHACTR1Q9C0D0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHACTR1Q9C0D0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHACTR1Q9C0D0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHACTR1Q9C0D0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHACTR1Q9C0D0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHACTR1Q9C0D0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PHACTR1Q9C0D0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHACTR1Q9C0D0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHACTR1Q9C0D0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHACTR1Q9C0D0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms