Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms