Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms