Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms