Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms