Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKNK1Q9BUB5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms