Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms