Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRACR2AQ9BSW2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms