Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIPSNAP3BQ9BS92 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms