Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HINFPQ9BQA5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HINFPQ9BQA5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HINFPQ9BQA5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HINFPQ9BQA5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HINFPQ9BQA5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HINFPQ9BQA5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HINFPQ9BQA5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HINFPQ9BQA5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HINFPQ9BQA5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HINFPQ9BQA5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HINFPQ9BQA5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HINFPQ9BQA5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HINFPQ9BQA5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HINFPQ9BQA5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HINFPQ9BQA5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HINFPQ9BQA5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HINFPQ9BQA5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HINFPQ9BQA5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HINFPQ9BQA5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HINFPQ9BQA5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HINFPQ9BQA5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HINFPQ9BQA5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HINFPQ9BQA5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms