Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RETNLBQ9BQ08 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms