Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms