Protein–RNA interactions for Protein: Q99325

ATG40, Autophagy-related protein 40, yeastyeast

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG40Q99325 YJR029WYJR029W 5268 nt0.9□□□□□ -2.26
ATG40Q99325 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.9□□□□□ -2.26
ATG40Q99325 YDL211CYDL211C 1119 nt0.9□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 YER188C-AYER188C-A 300 nt0.9□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.9□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.9□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.9□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.9□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.9□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 YGR265WYGR265W 411 nt0.9□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt0.9□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 EMC5YIL027C 426 nt0.9□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 RPL40BYKR094C 387 nt0.9□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 TIM18YOR297C 579 nt0.9□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt0.9□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 RAD50YNL250W 3939 nt0.9□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 SRP14YDL092W 441 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 QCR7YDR529C 384 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 YGL217CYGL217C 342 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 AFB1YLR040C 675 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 YNL319WYNL319W 441 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 SEC5YDR166C 2916 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 MAK10YEL053C 2202 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 DOP1YDR141C 5097 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 VMA21YGR105W 234 nt0.88□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 YNL114CYNL114C 372 nt0.88□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 YBL073WYBL073W 312 nt0.88□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt0.88□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 SLX4YLR135W 2247 nt0.88□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 ZRG17YNR039C 1818 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 HDA3YPR179C 1968 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 MSN5YDR335W 3675 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 YDL152WYDL152W 366 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 PRM8YGL053W 714 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 YIL029CYIL029C 429 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 SPC1YJR010C-A 285 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 NBP1YLR457C 960 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 HCH1YNL281W 462 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 YPR063CYPR063C 423 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 TTI1YKL033W 3117 nt0.86□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 HNT1YDL125C 477 nt0.86□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 PAU2YEL049W 363 nt0.86□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 YER175W-AYER175W-A 165 nt0.86□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 snR14snR14 160 nt0.86□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 IRC16YPR038W 360 nt0.86□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 MSS11YMR164C 2277 nt0.86□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 BUD3YCL014W 4911 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 SWI5YDR146C 2130 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 PPN1YDR452W 2025 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 GMC2YLR445W 567 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 GDS1YOR355W 1569 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 SLM6YBR266C 453 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 ROM2YLR371W 4071 nt0.84□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 YFL012WYFL012W 447 nt0.84□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 RTT102YGR275W 474 nt0.84□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt0.84□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 YLL020CYLL020C 306 nt0.84□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 YOP1YPR028W 543 nt0.84□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 YPR099CYPR099C 357 nt0.84□□□□□ -2.27
ATG40Q99325 SPR3YGR059W 1539 nt0.84□□□□□ -2.28
ATG40Q99325 SGO1YOR073W 1773 nt0.83□□□□□ -2.28
ATG40Q99325 PAN3YKL025C 2040 nt0.83□□□□□ -2.28
ATG40Q99325 YDR509WYDR509W 348 nt0.83□□□□□ -2.28
ATG40Q99325 PRE4YFR050C 801 nt0.83□□□□□ -2.28
ATG40Q99325 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt0.83□□□□□ -2.28
ATG40Q99325 SMC1YFL008W 3678 nt0.83□□□□□ -2.28
ATG40Q99325 snR84snR84 550 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG40Q99325 RPS18BYML026C 441 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG40Q99325 CTK3YML112W 891 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG40Q99325 RPL9BYNL067W 576 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG40Q99325 YBR032WYBR032W 303 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG40Q99325 VPS54YDR027C 2670 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG40Q99325 SHE9YDR393W 1371 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG40Q99325 EAF1YDR359C 2949 nt0.81□□□□□ -2.28
ATG40Q99325 YKL044WYKL044W 321 nt0.81□□□□□ -2.28
ATG40Q99325 SCC2YDR180W 4482 nt0.81□□□□□ -2.28
ATG40Q99325 YDL016CYDL016C 303 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG40Q99325 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG40Q99325 UBX4YMR067C 1251 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG40Q99325 YPR039WYPR039W 336 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG40Q99325 ZIP1YDR285W 2628 nt0.79□□□□□ -2.28
ATG40Q99325 YJR141WYJR141W 1044 nt0.79□□□□□ -2.28
ATG40Q99325 BER1YLR412W 825 nt0.79□□□□□ -2.28
ATG40Q99325 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.79□□□□□ -2.28
ATG40Q99325 STB6YKL072W 2301 nt0.79□□□□□ -2.28
ATG40Q99325 MUK1YPL070W 1839 nt0.79□□□□□ -2.28
ATG40Q99325 MKT1YNL085W 2493 nt0.79□□□□□ -2.28
ATG40Q99325 SWI4YER111C 3282 nt0.79□□□□□ -2.28
ATG40Q99325 SPT21YMR179W 2277 nt0.78□□□□□ -2.28
ATG40Q99325 CDC39YCR093W 6327 nt0.78□□□□□ -2.28
ATG40Q99325 RTR1YER139C 681 nt0.78□□□□□ -2.28
ATG40Q99325 ERP4YOR016C 624 nt0.78□□□□□ -2.28
ATG40Q99325 YBR071WYBR071W 636 nt0.78□□□□□ -2.28
ATG40Q99325 SNU56YDR240C 1479 nt0.78□□□□□ -2.28
ATG40Q99325 YLL054CYLL054C 2532 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG40Q99325 PIP2YOR363C 2991 nt0.77□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 111.4 ms