Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KC1Q96S38 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms