Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRAMP1Q96RY5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRAMP1Q96RY5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms