Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 LRRIQ3-202ENST00000370909 793 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms