Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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ODF3Q96PU9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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ODF3Q96PU9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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ODF3Q96PU9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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ODF3Q96PU9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ODF3Q96PU9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3Q96PU9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ODF3Q96PU9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ODF3Q96PU9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ODF3Q96PU9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ODF3Q96PU9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ODF3Q96PU9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ODF3Q96PU9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ODF3Q96PU9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ODF3Q96PU9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ODF3Q96PU9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ODF3Q96PU9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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