Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms