Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SCLT1Q96NL6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms