Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms