Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms