Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms