Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CCDC7Q96M83 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC7Q96M83 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms