Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF4Q96M43 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms