Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC17Q96LX7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms