Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ALPK3Q96L96 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms