Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJD4Q96KN9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms