Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPGRIP1Q96KN7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms