Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A4AQ96JQ5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms