Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NEURL4Q96JN8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NEURL4Q96JN8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NEURL4Q96JN8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NEURL4Q96JN8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEURL4Q96JN8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
NEURL4Q96JN8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEURL4Q96JN8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEURL4Q96JN8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEURL4Q96JN8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEURL4Q96JN8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEURL4Q96JN8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEURL4Q96JN8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEURL4Q96JN8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEURL4Q96JN8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
NEURL4Q96JN8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEURL4Q96JN8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEURL4Q96JN8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEURL4Q96JN8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NEURL4Q96JN8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEURL4Q96JN8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEURL4Q96JN8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NEURL4Q96JN8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEURL4Q96JN8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEURL4Q96JN8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEURL4Q96JN8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEURL4Q96JN8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEURL4Q96JN8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NEURL4Q96JN8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEURL4Q96JN8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEURL4Q96JN8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NEURL4Q96JN8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEURL4Q96JN8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEURL4Q96JN8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEURL4Q96JN8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEURL4Q96JN8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
NEURL4Q96JN8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEURL4Q96JN8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEURL4Q96JN8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEURL4Q96JN8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEURL4Q96JN8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms