Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAMP1Q96JM3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms